بهینه سازی استخراج DNA ژنومی باکتریایی به روش سیلیکاژل
Authors
Abstract:
Background & Objectives: Today, major progress has been made in molecular experiments. The first step towards improving these experiments is the accurate extraction of nucleic acid. In this study, a protocol for DNA extraction was proposed in accordance with silica gel method. DNA purification, developed based on the silica-gel-membrane technology, is a simple method, which involves three stages of binding, rinsing, and recycling. Nucleic acids, unlike polysaccharides and proteins, are absorbed by silica gel in the presence of chaotropic agents and are removed through rinsing. Following the stage of rinsing, purified nucleic acids are extracted from silica gel through rinsing with buffer or distilled water. Accordingly, the aim of the present study was to introduce a simple, high-quality DNA extraction method. Materials and Methods: In this study, eight bacterial samples, including three Gram-positive and five Gram-negative bacteria, were evaluated. DNA extraction of all specimens was performed, using dissolved silica gel. Optical density was measured by a spectrophotometer. Moreover, the quality of the samples was assessed through Agarose gel electrophoresis. The mean absorbance at 260/280 nm was estimated at 1.92. Also, electrophoresis of PCR products was performed on 1.5% Agarose gel. Results: The mean DNA absorbance at 260/280 nm in Gram-negative and Grampositive DNAs, extracted from whole blood cells, was 1 and 1.25, respectively. Based on the findings, Agarose gel electrophoresis of PCR products was shown to have good quality. Conclusion: According to the results of the present study, the proposed method showed higher efficacy for Gram-negative bacteria, compared to Gram-positive bacteria. Overall, gel silica method is recognized as a simple, cost-effective, and high-quality method. However, this method has several shortcomings, which can be resolved through increasing the assay time, improving the rinsing frequency, and altering the time of enzyme efficacy.
similar resources
بهینه سازی استخراج dna ژنومی باکتریایی به روش سیلیکاژل
سابقه و هدف:در عصر حاضر، آزمایشات مولکولی گسترش بسیاری پیدا نموده است. اولین گام در موفقیت این آزمایشات استخراج صحیح اسید نوکلئیک می باشد. در این مطالعه، دستور کاری برای استخراج dna براساس سلیکا ارائه گردیده است. خالص سازی dna براساس تکنولوژی غشاء سیلیکاژل یک روش ساده و شامل سه مرحله اتصال، شستشو و بازیابی می باشد. اسیدهای نوکلئیک برخلاف پلی ساکاریدها و پروتئی نها، در حضور نمک های کائوتروپیک ( ...
full textبهینه سازی روش استخراج DNA در Amygdalus spp
مقاله حاضر به ارائه روشی ساده جهت استخراج DNA ژنومی از گیاهان دارای متابولیتهای ثانویه زیاد می پردازد. در این روش برگهای جوان و برگهای نسبتاً مسن از گونه های مختلف بادام وحشی و نیز ارقام اهلی، به عنوان مواد گیاهی، مورد بررسی قرار گرفتند. دراین روش ازSDS به جای CTAB که عمدتاً برای استخراج DNAگیاهان حاوی پلی ساکارید زیاد بکارمیرود و نیز سارکوسیل که دارای هزینه نسبتاً بالایی می باشند، نمک NaCI با غلظ...
full textبه کارگیری 3 روش متفاوت استخراج DNA برای آنالیز بقایای ژنومی DNA در روغن خام و تصفیه شده سویا
زمینه مطالعه: روغن سویا یکی از پرمصرف ترین روغن‌های گیاهی در جهان است. این روزها، استفاده از دانه‌های سویا اصلاح ژنتیکی شده برای تولید روغن سویا به طور مداوم در حال افزایش می‌باشد. روش مناسب برای تشخیص گیاهان اصلاح ژنتیکی شده در روغن و غذا با میزان بالا فرآوری، روشی است که بر پایه آنالیز بقایای ژنتیکی موجود در غذا باشد. کارایی و تکثیر موفق DNA استخراج شده، شدیداً به روش مورد استفاده برای استخراج...
full textاستخراج DNA از ریشه مو با روش نمکی بهینه یافته
The reliability and performance of the molecular diagnostic assays such as polymerase chain reaction (PCR), enzyme digestion and other applications are influence by quantity and quality of the extracted DNA strongly. Furthermore, to choose suitable and optimal tissue for genomic experiments nevertheless consider quantity and quality of the extracted DNA, we need to consider the comfort of sampl...
full textمعرفی روش ساده و آسان برای استخراج DNA ژنومی در قارچهای رشتهای
امروزه روشهای مولکولی لازمه انجام بسیاری از تحقیقات می‌باشد. اساس کار اکثر این آزمایشات و تحقیقات مولکولی بر پایه استخراج DNA می‌باشد، از این رو انتخاب و کشف روش جدیدی که در عین نتیجه بخش بودن، کم هزینه، ساده، کم خطر و سریع نیز باشد بسیار حائز اهمیت است. تکنیک‌های معمولی که در بخش کشاورزی جهت استخراج DNA قارچهای رشتهای مورد استفاده قرار می‌گیرد شامل C-TAB، فنل کلروفرم و کیتهای آزمایشگاهی اس...
full textMy Resources
Journal title
volume 2 issue None
pages 31- 37
publication date 2016-04
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023